硫唑嘌呤毒副作用與硫代嘌呤甲基轉移酶(TPMT)多態性相關,研究表明突變純合子TPMT無活性或活性很低；突變雜合子TPMT活性中等或較低。美國FDA用藥指導中指出TPMT活性降低或缺失的患者，在接受標準劑量嘌呤類藥物治療時，極易造成骨髓抑制，應該酌情考慮降低劑量。