C-kit及PDGFRA突變類型可以預測伊馬替尼和舒尼替尼的療效。 1.其中C-kit外顯子11突變者使用伊馬替尼療效最佳； 2.舒尼替尼治療原發C-kit外顯子9突變和野生型GIST患者的生存獲益優于C-kit外顯子11突變患者； 3.PDGFRA D842V突變患者可能對伊馬替尼與舒尼替尼治療產生原發性耐藥； 4.對于伊馬替尼繼發耐藥患者使用舒尼替尼治療C-kit外顯子13、14突變者療效優于繼發C-kit外顯子17、18突變者。